کمیسیون عالی سوانح راهآهن با صدور اطلاعیهای درباره سانحه قطار مسافری مشهد – یزد علت اولیه وقوع این سانحه را بر اساس بررسی ریلی مکالمات ضبط شده مأمورین و وقایع ثبت شده در سیستمهای علائم الکتریکی، انسداد مسیر حرکت قطار مسافری توسط بیل مکانیکی و تخطی از سرعت مقرره اعلا کرد.
سازمان اطلاعات سپاه استان خراسان رضوی با صدور بیانیه ای در خصوص حادثه ناگوار امروز در حرم مطهر رضوی اعلام کرد: تحقیقات و بازجویی های تخصصی در حال انجام است.
آیت الله رییسی رییس جمهور با تاکید بر پرهیز از عملکرد سلیقه ای در دستگاه های دولتی، گفت: دستگاه ها سلیقه ای عمل نکنند و قانون را مد نظر داشته باشند و سیاست های نظام را دنبال کنند.